Organisasi berdasar Surat keputusan Rektor Universitas Mulia No. 010/SK/REKTOR/UM/II/2019 tanggal 16 Februari 2019 dan SK Yayasan no. 066/SK.A-HRD/Ketua-YA/I/2022 adalah sbb:

REKTOR DR. Drs. MUHAMMAD RUSLI, M.T
WAKIL REKTOR I YUSUF WIBISONO, S.E., M.TI.
WAKIL REKTOR II WISNU HERA PAMUNGKAS, S.TP., M.Eng.
WAKIL REKTOR III MUNDZIR, S.KOM., M.T.
STAFF AHLI Drs. SATRIA DHARMA
STAFF AHLI Dra. R. WAHYUNI TRIANA, M.Si.
DEKAN FAKULTAS ILMU KOMPUTER (FIKOM) JAMAL, S.Kom., M.Kom.
DEKAN FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS (FEB) IVAN ARMAWAN, S.E., M.M
DEKAN FAKULTAS HUMANIORA DAN KESEHATAN (FHK) VIDY, S.S., M.Si.
KEPALA KANTOR UM PSDKU SAMARINDA MUHAMMAD YANI, S.Kom,M.T.I