Organisasi berdasar Surat keputusan Rektor Universitas Mulia No. 010/SK/REKTOR/UM/II/2019 tanggal 16 Februari 2019 adalah sbb:

REKTOR AGUNG SAKTI PRIBADI, S.H., M.H.
PLT. REKTOR Ir. SIGIT SIGALAYAN, M.P.
WAKIL REKTOR I YUSUF WIBISONO, S.E., M.TI.
WAKIL REKTOR II Ir. SIGIT SIGALAYAN, M.P.
WAKIL REKTOR III MUNDZIR, S.KOM., M.T.
WAKIL REKTOR IV Ir. MOHAMAD ADRIYANTO, M.Sc.
STAFF AHLI Drs. SATRIA DHARMA
STAFF AHLI Dra. R. WAHYUNI TRIANA, M.Si.
STAFF AHLI Dr. EDI RAHMAD, M.Pd.
STAFF AHLI Ir. HERMAN WIDJAYANTO
DEKAN FAKULTAS ILMU KOMPUTER (FIKOM) WISNU HERA PAMUNGKAS, S.TP., M.Eng.
DEKAN FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS (FEB) NANY PANCAWARDANY, S.E., M.M.
DEKAN FAKULTAS HUMANIORA DAN KESEHATAN (FHK) VIDY, S.S., M.Si.
KEPALA KANTOR UM PSDKU SAMARINDA IR. RIYAYATSYAH, M.P.