Organisasi berdasar Surat keputusan Rektor Universitas Mulia No. 010/SK/REKTOR/UM/II/2019 tanggal 16 Februari 2019 dan SK Yayasan no. 066/SK.A-HRD/Ketua-YA/I/2022 adalah sbb:
| REKTOR | DR. Drs. MUHAMMAD RUSLI, M.T |
| WAKIL REKTOR I | YUSUF WIBISONO, S.E., M.TI. |
| WAKIL REKTOR II | WISNU HERA PAMUNGKAS, S.TP., M.Eng. |
| WAKIL REKTOR III | MUNDZIR, S.KOM., M.T. |
| STAFF AHLI | Drs. SATRIA DHARMA |
| STAFF AHLI | Dra. R. WAHYUNI TRIANA, M.Si. |
| DEKAN FAKULTAS ILMU KOMPUTER (FIKOM) | JAMAL, S.Kom., M.Kom. |
| DEKAN FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS (FEB) | IVAN ARMAWAN, S.E., M.M |
| DEKAN FAKULTAS HUMANIORA DAN KESEHATAN (FHK) | MADA ADITIA WARDANA, S.Sos., M.M |
| KEPALA KANTOR UM PSDKU SAMARINDA | MUHAMMAD YANI, S.Kom., M.T.I |