Organisasi berdasar Surat keputusan Rektor Universitas Mulia No. 048/SK/REKTOR/UM/VII/2024 adalah sbb:

REKTOR Prof. Dr. Ir. MUHAMMAD AHSIN RIFA’I, M.Si
WAKIL REKTOR I WISNU HERA PAMUNGKAS, S.T.P., M.Eng.
WAKIL REKTOR II YUSUF WIBISONO, S.E., M.T.I.
WAKIL REKTOR III SUMARDI S.Kom., M.Kom
STAFF AHLI Drs. SATRIA DHARMA
STAFF AHLI Dra. R. WAHYUNI TRIANA, M.Si.
DEKAN FAKULTAS ILMU KOMPUTER (FIKOM) DJUMHADI, S.T., M.Kom.
DEKAN FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS (FEB) Dr. IVAN ARMAWAN, S.E., M.M
DEKAN FAKULTAS HUMANIORA DAN KESEHATAN (FHK) Dr. MADA ADITIA WARDANA, S.Sos., M.M
KEPALA KANTOR UM PSDKU SAMARINDA TINA TRI WULANSARI, S.Kom., M.T.I.